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短信设置了骚扰拦截后，反诈中心的预警功能仍然有可能进行预警。
骚扰拦截和反诈预警是两个不同的功能，骚扰拦截主要是拦截一些广告、推销等不必要的短信或电话，而反诈预警则是针对一些诈骗行为进行的防范和预警，这两个功能虽然有一定的交集，但并不完全相同，反诈中心的预警系统是通过监测各种可能的诈骗行为，包括短信、电话、网络等多种方式，对用户的手机进行实时检测和预警，即使用户设置了骚扰拦截，反诈中心仍然可以通过其独立的监测系统进行预警。
具体的预警效果可能会受到手机设置、反诈中心系统的实时更新情况等因素的影响，为了确保能够接收到反诈中心的预警信息，建议用户保持手机系统的更新，并确保反诈中心软件的正常使用，用户也可以关注反诈中心的官方账号或网站，以获取更多关于诈骗的实时信息和防范建议。
虽然设置了骚扰拦截，但反诈中心的预警功能仍然有可能进行预警，用户应关注反诈中心的提示并采取相应措施，以确保个人财产安全。